蛋白质的结构

• ​一级结构

  • ​从N端到C端的氨基酸排列顺序

  • ​维持结构的化学键：肽键

• ​三级结构

  • ​定义：整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置

  • ​结构域（独立功能区）

    • 结构域​定义：分子量较大的蛋白质可折叠成多个结构独立较为紧密且稳定的区域，并各执行其功能

  • ​维持结构的化学键：疏水作用、离子键、氢键、范德华力

• ​四级结构

  • ​定义：蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用

  • ​各亚基间的结合力主要是：氢键、离子键

• ​二级结构

  • ​主链骨架原子的相对空间位置

  • ​常见二级结构

    • ​ $α$ 主要形式

      • ​ $α$ -螺旋

        • ​特点

          • ​右手螺旋上升

          • ​每3.6个氨基酸残基螺旋上升一圈，螺距0.54nm

          • ​氨基酸侧链伸向螺旋外侧

          • ​每个肽键的羰基氧和第四个肽键的N-H形成氢键，是维持二级结构形态的主要化学键，其方向与螺旋长轴平行

        • ​影响 $α$ -螺旋形成的原因

          • ​肽链中含有Pro

          • ​多个酸性或碱性氨基酸残基相邻

          • ​有侧链较长的氨基酸残基（例如：Asp和Leu）

      • ​ $β$ -折叠

    • ​ $α$ -转角

    • ​无规则卷曲

  • ​模体

    • 蛋白质分子中具有特定空间构象和特定功能的结构成分。
      

    • ​其中一类是具有特殊功能的超二级结构。